明朝末年，外有北虏南倭，内有农民起义，整个神州大地风雨飘摇，自崇祯皇帝即位以后，励精图治，铲除以魏忠贤为首的阉党，并重用东林正党，加强东北边防，以抵御努尔哈赤领导的后金军的进攻，还调派军队平定东南倭寇 ，对内则实行休养生息的政策 ，使得粮食收成也开始逐年回升，大明朝似乎有了一丝回光返照的迹象。
但追剿阉党余孽的任务也一直没有停歇，而所谓东林正党，也并非铁板一块，内部派系林立，互相之间的明争暗斗，以及贪污受贿比起阉党来说，只能是有过之而无不及，他们中更不乏大奸大恶之人，内阁大学士高阶正便是这样一个人面兽心的老臣，直言敢谏的言官在他眼里就是眼中钉，肉中刺。
言管领袖秋喀沙不畏权贵，屡屡扬言要弹劾高阶正，这让他怀恨在心，便给秋喀沙安了个阉党余孽，勾结外敌的莫须有的罪名，崇祯皇帝被妖言蛊惑，竟要派了一众大内高手去杀光秋家上上下下五十多口人，秋言官不知情况，悲愤至极，运起家传武功打死数名高手，奈何双拳难敌四手，那些武士中又高手甚多，秋喀沙渐渐体力不支，惨死于乱刀之下，于是八月十五那天晚上，秋府陷入了一片熊熊大火中，刀光剑影中只有两位仆人拼死救出了秋家最小的女儿——秋灵儿，而那两位仆人家丁却因伤势过重而身亡。
秋灵儿虽然只是个年方二八的小女孩，但秋家代代习武，因此这秋灵儿也是个武艺高强、身手敏捷的好手，她在水沟之中仅凭一截芦苇躲过了来来往往的士兵，并擒杀了一个落单的士兵，并夺其兵刃，穿上夜行服，要趁着夜色从水道潜入皇宫大内刺杀崇祯，以报那血海深仇！
谁料大内之中，高手如云，秋灵儿行踪败露，仓皇之间逃到了幽静的公主阁中，谁料那公主居然是个冒牌货，而且是自己家曾经收养的苗族少女夜青蓝！在一番误会之后，夜青蓝将秋灵儿藏在了公主阁中。
夜青蓝多年以前对着秋灵儿不告而别，游历江湖，多有奇遇，年纪轻轻就将那天下至阴至邪的苗族失传已久的禁术《天毒诀》练的如火纯青，若是施展起那“天蛇变”来，就是武林中的前辈高人，也罕有人敌，但是，与脾气刚烈火爆的秋灵儿比起来，看上去古灵精怪的夜青蓝虽然聪明非凡，但脾气却太过温和软弱，从不愿意杀生，以至于用袖中唯一能毒伤她的灵蛇来咬自己，使她骨骼萎缩，身材娇小，头发也被毒的乌黑，全身皮肤惨白，总是在咳嗽着，饶以是这样，她的武功也仅仅比秋灵儿弱一点。
而夜青蓝当年从秋家出走，一方面自己身患绝症，想要寻得《天毒诀》来医治自己，另一方面竟是对秋灵儿有着难以启齿的情愫，阴差阳错当了韶仁公主之后，为了逃避自己对秋灵儿的感情，再也没有打听过她的下落，而今重逢，夜青蓝的内心土崩瓦解，无可救药的追求着秋灵儿，同时也为了让秋灵儿不要急于报仇，在夜青蓝的死缠烂打之下，秋灵儿的心结慢慢解开，两人的感情慢慢升温，度过了一段鸡飞狗跳的的幸福时光。
但是在上元节的时候，两人在茶楼里偶遇北方武林统领天下会紫衣尊者和丐帮赵帮主，他们惊喜的发现秋灵儿正是他们一直在找的东瀛侠士的后代，原来，秋灵儿也是被收养来的！
但他们也看出夜青蓝所练的正是曾经让他们闻风丧胆的天蛇邪功，为了不养虎为患，便支开秋灵儿，一路追杀夜青蓝，几乎要将夜青蓝打死，在危机关头，秋灵儿及时现身，以死相逼之下才让紫衣尊者和赵帮主停手，两人之间也由这件事情确认了彼此的心意，破除隔阂真正的生活在了一起，夜青蓝在秋灵儿面前称自己为妻子，而秋灵儿便做起了她的主人，同时对自己的东瀛身份不以为意，仍然把自己当做一个汉人。
一年后，清兵入关，北京城破，高阶正身亡，两人匆匆南下避难，秋灵儿建议让夜青蓝陪着自己去日本，夜青蓝欣然同意，但到了泉州的时候，精通方术的夜青蓝却将秋灵儿催眠洗脑，让她一个人前去日本，自己则含着眼泪一个人日夜兼程的向北赶去。
原来，这一年来夜青蓝一直只让秋灵儿碰自己，而自己却没有碰秋灵儿，因为她骨子里还是希望秋灵儿以后能有更大的成就，而不是为流言碎语所脱累，更是因为当年真正的韶仁公主临死前就已经预料到不久之后清军将会入关，明军定然无力阻挡，只能退到南方，迫使李自成的大西军和张献忠的大顺军同明军同仇敌忾，效仿南宋东晋，凭借长江天险与清人南北对峙，而韶仁公主身上又有与清人的婚约，清人长驱直入，腹背受敌，正好会借此机会达成城下之盟，南明政权也得以有了一个喘息的机会，希望日后挥师北上，收复失地。
夜青蓝当时只是假冒公主的侍女， 公主得知她的异术之后，便以自己体弱多病，没有见过几个人为由乞求夜青蓝冒充自己，以免生灵涂炭，夜青蓝心地善良，想起了自己幼年时颠沛流离的生活，一时心软便答应了她，不久公主死去，夜青蓝微微易容，便轻而易举的假冒了她。
不料后来发生的事情竟和那公主所料一模一样，夜青蓝亲眼见到那扬州十日，嘉定三屠，认清了自己的命运，独自来到南京，而南京众人也在找她，于是，不久之后，夜青蓝身着嫁衣，手脚都被铁链锁住，随着车队远赴蒙古大漠和亲。
与此同时，秋灵儿也在海上举行着自己盛大的婚礼 ，关键时刻，夜青蓝的师父突然出现，点醒了秋灵儿，秋灵儿泪如雨下，当机立断，来不及脱下身上嫁衣，不远千里单枪匹马的朝着大漠抢婚而去。
在随行队伍来到蒙古大漠地界的时候，秋灵儿终于追了上来，奋起神威杀出一条血路，来到夜青蓝身边，并斩断了锁链，夜青蓝终于舍弃了世界种种，翻身上马，跟着秋灵儿向西逃去，数百明军骑兵追杀着她们，但碍于公主没有放箭，但在她们即将逃走的时候，那匹夜青蓝给秋灵儿的汗血宝马却精疲力竭，倒地身亡，两人一齐跌下马来，又发现清蒙骑兵不知何时将两人围的水泄不通，两人恐怕是插翅难逃了。
两人心意相通，自知大限将至，借着自己身上所穿嫁衣，以天地为证，正式结为夫妻，然后各执兵器，浴血奋战，想要突围出去，就在她们皆已身负重伤，体力不支，情况万分凶险的时候，却忽的来了一阵猛烈的龙卷风，将远方夜青蓝乘坐的巨大马车都给卷上天空扯成碎片，清军将领顿时下令撤离，两人因这天佑得以逃出生天，一路来到了东海泛舟钓鱼，想等紫衣尊者同意了两人的婚事之后再回到东瀛，本篇的故事也是从这个时候开始的。
